ドライ解析

解析手法

【Part 2】FASTQファイルの前処理・クオリティチェックのやり方について詳しく解説!

はじめに 前回はFATSQファイルのダウンロードまで行いました。今回は下記の記事の続きとなります。 次世代シークエンサーまたは公共データベースから取得したFASTQファイルは、アダプター配列や低品質なリードを含んでいます... Read more
解析手法

【Part 1】SRAからFASTQをダウンロードする方法を詳しく解説!

はじめに 今回は公共データベースに保存されているsra形式のシークエンスデータをダウンロードし、fastq形式のファイルを取得する方法について、実際の論文データを用いて詳しく解説していきます(図1)。誰でも再現できるよう... Read more
解析手法

【Part 0】RNA-seq解析(ドライ解析編)の流れを詳しく解説!

はじめに RNA-seq解析では、解析の過程で様々な種類のファイルと解析ツールが登場するので、「それぞれのファイルには何の情報が格納されているのか?」、「どの解析ツールを使えばいいのか?」「次の解析は何をしたらいいのか?... Read more